El JET contribuye con el estudio y conservación de las especies de Flora, Fauna y Funga con valor etnobiológico. Cuenta con colecciones de plantas vivas como medicinales, alimentarias, agaves, cactáceas y un jardín polinizador. Posee un TLXM que ya contaba con una colección previa de plantas y hongos, a los que se han sumado los generados en el proyecto del JET y que actualmente suman en conjunto cerca de 20,000 especímenes.
También cuenta con colecciones digitales y de exhibición que incluyen una fototeca con imágenes de plantas, hongos y polinizadores como colibríes y mariposas. Los dispositivos incluyen un terrario y cajas para exhibición de hongos y mariposas.
